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柳叶刀:主要城市疫情潜在传播预报将滞后武汉1

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  来源:大数据文摘(ID:BigDataDigest)

  一边是疫情防控,一边是春运返程,今年的复工之路注定不平凡。

  尽管推迟了上班时间,但百度地图迁徙大数据平台显示,1月30日(大年初六)春运返程潮依然如期而至,重庆、成都、南充、邵阳、盐城等劳动力输出区域成为热门迁出城市,北上广深、东莞、苏州等工业发达地方成为热门迁入城市。

  1月31日,香港大学的最新模型研究估计,截至2020年1月25日,中国武汉市可能有多达75800人感染了2019年新型冠状病毒(2019-nCoV),并且因为这次的春运,相当数量的2019-nCoV感染病例可能已经从武汉潜入到了中国多个主要城市中。

  论文估计,截至2020年1月25日,武汉预计有75815人(95% CrI 37304-130330)感染。感染人数翻倍时间为6.4天(95% CrI 5.8ー7.1)。此外,在这个时间节点中,重庆、北京、上海、广州和深圳分别从武汉输入病例估计值为461例113例98例111例80例感染。如果2019-nCoV 的传播能力在国内各地都是相似的,并且随着时间的推移,疫情会在中国多个主要城市呈指数增长,大概滞后于武汉爆发的大约1-2周

  这篇发表在《柳叶刀》上的论文,基于人口流动、确诊病例和病毒的序列间隔估计值(感染者感染其他人所需的时间)三个数据来源,对武汉地区疫情规模做出了估计,并基于易感-暴露-传染-恢复集合种群模型,对我国主要城市和主要国际城市的疫情进行模拟,得出了一篇潜在传播的临近预报,也给这次的春运返程拉响警铃。

  论文地址:

  https://www.thelancet.com/journals/lancet/article/PIIS0140-6736(20)30260-9/fulltext#tbl1

  基本再生数R0为2.68,武汉感染人数或达75815

  武汉是中国的交通枢纽,春运期间,相当数量的2019-nCoV感染病例从武汉潜入到了中国多个主要城市中,其数量足以引发当地疫情爆发。

  在这项研究中,研究人员根据官方发布的2019-nCoV病例数据以及国内和国际人口流动数据,来估计此次疫情的规模,并假设2019-nCoV的序列间隔估计值(感染者感染其他人所需的时间)与SARS-CoV的序列间隔估计值相同来建立预测模型。

  数据的来源主要有三个部分:

人口的流动数据来自于《官方航空指南》中关于每月机票预订量的数据,以及中国大陆300多个地级城市从腾讯数据库中获得的人员流动性数据。

确诊病例的数据来自中国疾病预防控制中心发表的报告。

系列间隔估计是基于以前对严重急性唿吸综合症冠状病毒(SARS-CoV)的研究。

  之后采用易感-暴露-传染-复原集合种群模型对我国主要城市的疫情进行模拟。基本再生数R0是用马尔科夫蒙特卡洛方法估计的,结果为2.68(95% CrI 2.47-2.86)。

武汉地区基本再生数R0和估计暴发规模的后验分布

  研究人员估计,在疫情爆发的早期阶段,也就是在2019年12月1日到2020年1月25日期间,每个感染2019-nCoV病毒的患者平均可能感染多达2-3人,而且这种流行病的规模每6.4天就能翻一番。在此期间,武汉可能有多达75815人被感染。

  据估计,截至1月25日,不少2019-nCoV感染病例可能已经从武汉进入其他主要城市,包括广州(111例)、北京(111例)、上海(111例)和深圳(111例)

  此外,由于前期的航空输入,全球其他主要城市也可能受到较大影响。

  2019年1月至2月,武汉出境航班最多的中国大陆以外的主要城市